胶原蛋白肽主要是从富含天然胶原蛋白的动物原料中，经过酶解、提纯等工艺分解制成的小分子肽，目前市面上的成品胶原蛋白肽基本都来自动物原料，没有人工合成的商品胶原肽。
目前市面上主流的胶原蛋白肽原料，主要分为深海鱼源（鱼皮、鱼鳞）、畜禽源（牛骨、猪皮、牛皮）两大类，还有少量小众原料来自蛋壳膜、鱼鳔等部位，不同原料提取出来的成品特性有一定差别。
具体来看，原料带来的区别主要体现在成本、气味、致敏性三个方面：深海鱼来源的胶原蛋白肽，整体脂肪含量低，成品腥气小，对牛羊类过敏原敏感的人群也能吃，因此售价通常更高；畜禽来源的胶原蛋白肽，氨基酸组成和人体自身胶原蛋白更接近，原料成本更低，售价也更亲民，只要原料检测合格，安全性也有保障。
选胶原蛋白肽的时候不用过度追捧“特殊原料”的概念，只要是正规厂家生产、分子量符合小分子要求的产品，都能满足日常补充需求，优先选择原料来源可追溯的产品即可。