胶原蛋白肽主要以动物皮、骨骼、筋腱等动物结缔组织为原料制作，市面主流产品的原料多为鱼皮鱼鳞、牛骨牛皮，少数为猪皮猪骨等其他动物来源。
胶原蛋白肽本质是胶原蛋白水解后得到的小分子片段，制作时会先从原料中提取出胶原蛋白，再通过酸解、酶解等工艺把大分子胶原蛋白分解成容易吸收的小分子肽段，最后经过过滤提纯、干燥，就能得到我们买到的胶原蛋白肽成品。不同原料的成品特性各有不同，目前深海鱼皮来源的胶原蛋白肽因为异味小、分子量小、吸收率高，占据了大半的市场份额。
关于胶原蛋白肽原料的安全性，正规品牌产品所用的原料都是符合食品安全生产标准的，不仅来源可追溯，还会经过严格的检疫检验，后续加工也有多道除杂灭菌工序，不会携带病菌、重金属超标等安全问题。只有少数三无小作坊，会用变质的劣质工业下角料做原料，才可能存在安全隐患。
大家选购胶原蛋白肽的时候，优先选明确标注原料来源、带有正规资质认证的品牌产品，避开来源不明的三无散装产品，就能基本规避安全风险。