常规HE染色条件下，胶原纤维HE染色的最终颜色为粉红色或亮红色。
HE染色是病理组织学最常用的染色方法，染色流程中先通过苏木精对细胞核内带负电的核酸等碱性物质染色，使其呈现蓝紫色，再通过伊红对细胞质、细胞外基质中带正电的嗜酸性成分染色，使其呈现红色系。胶原纤维的主要成分是胶原蛋白，整体偏嗜酸性，和伊红的亲和力强，因此最终会被染成粉红色，染色充分、新鲜的切片中还会呈现偏亮的红色。
在常规HE染色中，弹性纤维和胶原纤维同属纤维结缔组织成分，二者的颜色存在细微差异：弹性纤维因为和伊红亲和力更弱，一般染色后呈现浅粉红色，颜色远浅于胶原纤维，常规切片中很难和周围的胶原纤维区分开，因此如果需要观察弹性纤维的形态和分布，一般会改用特殊染色法进行显示。
病理组胚读片时，受切片固定时间、染色时长、试剂浓度影响，胶原纤维的染色深浅可能会略有浮动，只要染色流程合规，胶原纤维就依然会呈现粉红色调，不会出现大幅的颜色偏差。