大部分情况下，脸部凹陷填充优先选择玻尿酸，仅轻度小部位凹陷、有额外提亮淡纹需求的人群可以选择胶原蛋白。
玻尿酸是目前临床应用很广的填充材料，支撑力强，不同分子大小能适配不同部位的凹陷——深层的颞部凹陷、大面积脸颊凹陷可以用大分子玻尿酸，支撑性够塑形效果稳定；浅表层的泪沟、法令纹凹陷可以用小分子，手感更自然。而胶原蛋白本身是人体皮肤原本就有的成分，优势是质地柔软，不会出现透光显假的问题，还能刺激自身胶原生成，改善暗沉细纹，但它的支撑力弱，填深层大面积凹陷很容易快速变松散达不到塑形效果，而且单价普遍比玻尿酸高，性价比不高。
两者都会被人体代谢，维持时间有明显差异。玻尿酸的维持时间看分子大小，小分子玻尿酸一般维持6~12个月，中分子维持12~18个月，大分子可以维持18~24个月，多次填充后，代谢速度会变慢，维持时间也会相应延长。胶原蛋白因为本身是人体同源蛋白，大多没有玻尿酸那么强的交联性，多数产品维持时间在6~12个月，就算是交联款，最长也只能维持12~18个月，整体维持时间比玻尿酸短。
无论是选玻尿酸还是胶原蛋白，都要认准正规获批的产品，一定要找有资质的整形科或皮肤科医生操作，才能保障填充的安全和效果。