胶原蛋白溶解酶必须由正规医疗机构的专业医护人员操作，严禁个人自行使用，具体用法和用量需要根据个人填充胶原蛋白的实际情况调整。
使用前需要先做过敏测试，取少量稀释后的溶解酶做皮下注射，观察15-30分钟，确认无瘙痒、红肿、晕厥等过敏反应后，才能开展后续操作。配制时一般将1500单位的胶原蛋白溶解酶，用2-3ml生理盐水稀释后备用。用量上大致遵循“1单位溶解酶对应溶解1ml胶原蛋白”的比例，实际操作中医护会根据胶原蛋白填充时间、填充范围、部位做微调，单次注射总剂量一般不会超过1500单位，避免过量引发副作用。操作时会将溶解酶多点注射到胶原蛋白填充部位，推动药物充分接触填充组织，完成溶解。
打完胶原蛋白溶解酶后，24小时内注射部位要保持干燥清洁，不能沾水、不能涂抹化妆品，避免引发针孔感染；一周内要避免按压揉搓注射部位，不要出入蒸桑拿、泡温泉等高温场所，同时要严格忌口辛辣刺激、易致敏的食物，戒烟戒酒，日常还要做好注射部位的防晒，避免色素沉着。如果打完后出现严重红肿疼痛、皮肤破溃的情况，要及时联系医生处理。
胶原蛋白溶解酶是用于修复胶原蛋白填充过量的医疗用品，本身存在过敏风险，一定要选择正规机构操作，切不可自行购买注射。