胶原蛋白本身缺少半胱氨酸和色氨酸两种必需氨基酸。
作为人体皮肤、韧带、筋膜等组织的核心结构蛋白，胶原蛋白的氨基酸组成有非常明显的偏向性，甘氨酸占总氨基酸占比的三分之一左右，脯氨酸和羟脯氨酸加起来也占到了三分之一，剩下的各类氨基酸占比不高，其中人体必需的色氨酸和半胱氨酸含量极低，远达不到人体所需的营养标准，因此公认胶原蛋白缺少这两种氨基酸。
针对补充胶原蛋白是否需要额外补氨基酸这个问题，答案是需要补足缺失的这两种氨基酸。如果日常是通过猪蹄、肉皮等天然食材补充胶原蛋白，这些食材通常会和其他餐食一起摄入，肉蛋奶、谷物中本身就含有充足的色氨酸和半胱氨酸，一般不用额外补充。如果是服用纯胶原蛋白补剂，这类补剂大多只提纯了胶原蛋白，需要额外搭配富含这两种氨基酸的食物，或是选择添加了必需氨基酸的复合补剂。
不用因为胶原蛋白缺少两种必需氨基酸就否定它的营养价值，它本身提供的甘氨酸、羟脯氨酸对皮肤和关节健康依然有帮助，只要日常饮食均衡就能补足缺失的营养。