胶原蛋白的氨基酸组成是由重复的甘氨酸-X-Y三肽序列构成，其中X多为脯氨酸，Y多为羟脯氨酸。
目前已经发现的28种胶原蛋白中，大多数纤维型胶原蛋白都保留着这种高度保守的重复氨基酸排列特征，只有少数非纤维胶原蛋白的重复结构不够规律。这种均匀的重复排列，刚好满足空间结构需求：分子量最小的甘氨酸位于三螺旋内侧，能让三条肽链紧密缠绕，脯氨酸和羟脯氨酸的环状结构则可以进一步稳定螺旋构象。
从护肤角度来说，胶原蛋白的重复结构直接影响了它的功效表现：完整保留重复三螺旋结构的胶原蛋白分子量很大，通常在30万道尔顿以上，很难直接穿透皮肤角质层被吸收，外用涂抹很难达到真皮层，口服也无法直接以完整结构到达皮肤。经过酶解切割得到的小分子胶原肽，保留了部分特征性重复序列，分子量多在几千道尔顿，更容易被人体吸收，也更能发挥促进皮肤锁水、刺激自身胶原蛋白合成的作用。
选购胶原蛋白类产品时，不需要盲目追求完整的天然重复结构，适合的分子量才是影响吸收效率的核心因素。